home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00725 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.4 KB  |  54 lines
  1. ***********************************
  2. * Gamma-thionins family signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. The following small plant proteins are evolutionary related:
  6.  
  7.  - Gamma-thionins from  the endosperm of wheat (gamma-purothionins) and barley
  8.    (gamma-hordothionins) which  are toxic to animal  cells and inhibit protein
  9.    synthesis in cell free systems [1].
  10.  - A flower-specific thionin (FST) from tobacco [2].
  11.  - Antifungal proteins (AFP) from  the seeds  of Brassicaceae  species such as
  12.    radish, mustard, turnip and Arabidopsis thaliana [3].
  13.  - Inhibitors of insect alpha-amylases from sorghum [4].
  14.  - Probable protease inhibitor P322 from potato.
  15.  - A germination-related protein from cowpea [5].
  16.  - Anther-specific protein  SF18  from sunflower [6].  SF18 is a  protein that
  17.    contains a  gamma-thionin  domain  in  its N-terminal and a proline-rich C-
  18.    terminal domain.
  19.  
  20. In their mature form  these proteins generally consist of about 45 to 50 amino
  21. acid  residues.  As shown  in  the  following schematic  representation, these
  22. peptides contains  eight conserved  cysteines  that are  involved in disulfide
  23. bonds.
  24.  
  25.           +-------------------------------------------+
  26.           |          +-------------------+            |
  27.           |          |                   |            |
  28.         xxCxxxxxxxxxxCxxxxxCxxxCxxxxxxxxxCxxxxxxCxCxxxC
  29.         *******************|***|                | |
  30.                            +---|----------------+ |
  31.                                +------------------+
  32.  
  33. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  34. '*': position of the pattern.
  35.  
  36. -Consensus pattern: [KR]-x-C-x(3)-[SV]-x(2)-[FYWH]-x-[GF]-x-C-x(5)-C-x(3)-C
  37.                     [The four C's are involved in disulfide bonds]
  38. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  39. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  40. -Last update: June 1994 / First entry.
  41.  
  42. [ 1] Bruix M., Jimenez M.A., Santoro J., Gonzalez C., Colilla F.J., Mendez E.,
  43.      Rico M.
  44.      Biochemistry 32:715-724(1993).
  45. [ 2] Gu Q., Kawata E.E., Morse M.-J., Wu H.-M., Cheung A.Y.
  46.      Mol. Gen. Genet. 234:89-96(1992).
  47. [ 3] Terras F.R.G., Torrekens S., van Leuven F., Osborn R.W., Vanderleyden J.,
  48.      Cammue B.P.A., Broekaert W.F.
  49.      FEBS Lett. 316:233-240(1993).
  50. [ 4] Bloch C. Jr., Richardson M.
  51.      FEBS Lett. 279:101-104(1991).
  52. [ 5] Ishibashi N., Yamauchi D., Miniamikawa T.
  53.      Plant Mol. Biol. 15:59-64(1990).
  54.